MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. HZ2

Total Repeats: 8717

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021879	ATG	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021879	T	6	6	35	40	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021879	TGT	2	6	46	51	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021879	TAA	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021879	TTC	2	6	61	66	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021879	TA	3	6	2800	2805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021879	ATG	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021879	GCA	2	6	5207	5212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021879	ACG	2	6	5226	5231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021879	ATCT	2	8	5613	5620	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021879	CTAT	2	8	5638	5645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021879	GAA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021879	AAG	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021879	GTA	2	6	5758	5763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021879	AAAT	2	8	5824	5831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021879	A	6	6	5922	5927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021879	ATTA	2	8	5944	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021879	A	6	6	5957	5962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021879	CAAT	2	8	5980	5987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021879	TTG	2	6	6039	6044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021879	AAG	2	6	6090	6095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021879	AGA	2	6	6124	6129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021879	TGT	2	6	6133	6138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021879	T	6	6	7030	7035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021879	GAG	2	6	7038	7043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021879	GC	3	6	7744	7749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021879	GTT	2	6	7770	7775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021879	CAA	2	6	7843	7848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021879	ATT	2	6	9085	9090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021879	ATA	2	6	9095	9100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021879	ATA	2	6	9105	9110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021879	ATA	2	6	9119	9124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021879	TAAGT	2	10	9148	9157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021879	TGT	2	6	9229	9234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021879	GT	3	6	10500	10505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021879	A	6	6	10628	10633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021879	GTAT	2	8	10634	10641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021879	AGC	2	6	10650	10655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021879	AT	3	6	10694	10699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021879	ATAA	2	8	10702	10709	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021879	AAT	2	6	10716	10721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021879	A	6	6	10760	10765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021879	ATA	2	6	10790	10795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021879	A	7	7	10903	10909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021879	AGA	2	6	10964	10969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021879	CATAG	2	10	10976	10985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021879	GAT	2	6	11031	11036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021879	GT	3	6	11045	11050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021879	CTG	2	6	11065	11070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021879	GCA	2	6	11087	11092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021879	TAT	2	6	11095	11100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021879	AAG	2	6	11156	11161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021879	AGC	2	6	11214	11219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021879	CTAT	2	8	11343	11350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021879	TGC	2	6	11360	11365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021879	AT	3	6	11370	11375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021879	TAA	3	9	11461	11469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021879	A	7	7	12152	12158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021879	TGGGA	2	10	12163	12172	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021879	TAA	2	6	12238	12243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021879	TAA	2	6	12264	12269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021879	A	6	6	12268	12273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021879	ACT	2	6	12301	12306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021879	TAA	2	6	12330	12335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021879	CAT	2	6	12365	12370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021879	TATCT	2	10	12392	12401	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021879	CTT	2	6	15408	15413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021879	T	6	6	15412	15417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021879	GAA	2	6	15427	15432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021879	ATC	2	6	17484	17489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021879	TA	4	8	20557	20564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021879	AAT	2	6	20649	20654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021879	TGTT	2	8	20711	20718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021879	ACA	2	6	20735	20740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021879	T	7	7	20772	20778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021879	CA	3	6	20851	20856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021879	AAAAT	2	10	20879	20888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021879	CAG	2	6	21834	21839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021879	T	6	6	22335	22340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021879	ATT	2	6	23596	23601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021879	T	6	6	23658	23663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021879	T	6	6	23669	23674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021879	TAA	2	6	24493	24498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021879	AAG	2	6	25919	25924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021879	ACAAT	2	10	25929	25938	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021879	TAA	2	6	25941	25946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021879	ATA	2	6	25974	25979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021879	TAA	2	6	25990	25995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021879	AGG	2	6	26042	26047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021879	T	6	6	26075	26080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021879	TTTA	2	8	26120	26127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021879	ATT	2	6	26192	26197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021879	GA	3	6	26226	26231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021879	TAG	2	6	26823	26828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021879	TAC	2	6	26855	26860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021879	TAA	3	9	26891	26899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021879	TTAT	2	8	26918	26925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021879	CTAG	2	8	26928	26935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021879	AT	3	6	26996	27001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021879	TC	3	6	27107	27112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021879	GTAC	2	8	27198	27205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021879	GTA	2	6	27232	27237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021879	AGC	3	9	27871	27879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021879	AAC	2	6	27901	27906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021879	TAG	2	6	27928	27933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021879	CTT	2	6	27948	27953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021879	CT	3	6	27954	27959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021879	AAT	2	6	27960	27965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021879	AAT	2	6	28006	28011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021879	ATA	2	6	28029	28034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021879	AAT	2	6	28046	28051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021879	GTA	2	6	28069	28074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021879	TCT	2	6	28275	28280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021879	ATT	2	6	28305	28310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021879	CTTA	2	8	28488	28495	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021879	AAGC	2	8	28578	28585	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021879	A	6	6	28706	28711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021879	ACT	2	6	28717	28722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021879	TCA	2	6	28740	28745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021879	ACGC	2	8	30736	30743	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021879	TGT	2	6	30786	30791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021879	TAA	2	6	31138	31143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021879	ATTA	2	8	31150	31157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021879	AAC	2	6	31212	31217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021879	ATC	2	6	31232	31237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021879	ATT	2	6	31269	31274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021879	CGGA	2	8	31290	31297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021879	TCCG	2	8	31370	31377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021879	GTA	2	6	31410	31415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021879	GAA	2	6	31440	31445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021879	TAT	2	6	31465	31470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021879	AT	3	6	31479	31484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021879	ACG	2	6	31487	31492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021879	CGT	2	6	31503	31508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021879	TGC	2	6	31547	31552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021879	CAG	2	6	31579	31584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021879	ATT	2	6	31610	31615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021879	TA	3	6	33309	33314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021879	ATA	2	6	36476	36481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021879	AT	3	6	36573	36578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021879	AAT	2	6	36601	36606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021879	TG	3	6	37676	37681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021879	GAG	2	6	37917	37922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021879	TG	3	6	38007	38012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021879	GGTA	2	8	38727	38734	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021879	GCA	2	6	38762	38767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021879	ATT	2	6	38784	38789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021879	GTTT	2	8	38793	38800	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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